Die Maltesischen Inseln werden außerdem im Rahmen von Kreuzfahrten oder Fährverbindungen von verschiedenen Mittelmeerhäfen aus mit dem Schiff angelaufen. Maltas Naturhäfen und Marinas machen die Inseln zu einem beliebten Segelziel im Mittelmeer.
Malta – Sizilien
Die Reederei Virtu Ferries bietet zwei Fährverbindungen zwischen Italien und Sizilien: Catamaran Express Fähre ab/bis Pozzallo (Fahrzeit ca. 2 Stunden)
Autofähre ab/bis Catania (Fahrtzeit 4 Stunden)
Malta – Gozo
Gozo erreicht man komfortabel mit der Autofähre, die von früh morgens bis spät in die Nacht regelmäßig den Norden Maltas mit Gozos Hafen Mgarr verbindet. Die Überfahrt dauert etwa 20 Minuten. Den Fahrpreis entrichtet man bei der Rückreise aus Gozo. www.gozochannel.com
Malta/ Gozo – Comino
Das einzige Hotel der kleinen Insel Comino bietet einen eigenen Bootstransfers nach Malta und Gozo an.